Trong một cuộc Chiến Tranh Chén Thánh, các Pháp sư (Master) và Anh linh của họ (Servant) phải chiến đấu để giành quyền kiểm soát Chén Thánh — một thiết kế có khả năng ban điều ước vạn năng. Kể từ khi Cuộc Chiến Tranh Chén Thánh lần thứ năm kết thúc tại Nhật Bản, đã có nhiều năm trôi qua. Hiện nay, có những dấu hiệu cho thấy sự xuất hiện của một Chén Thánh mới tại thành phố Snowfield, phía Tây nước Mỹ. Theo như dự đoán, các Master và Servant bắt đầu tụ hội tại đây.
Tuy nhiên, một lớp Servant lại bị mất tích, và nhiều lần triệu hồi Servant không thể diễn ra. Một quốc gia đang bị bao phủ trong bức màn bí mật, và một thành phố đã được tạo ra để làm chiến trường cho cuộc chiến anime hay này. Trước những bất thường đó, Cuộc Chiến Tranh Chén Thánh đã bị bẻ cong và đẩy vào vực thẳm của sự điên rồ.
Bức màn hãy kéo lên cho một buổi dạ vũ của con người và những anh hùng, được tạo ra để nhảy múa trên sân khấu của một Chén Thánh giả tạo. Đó chính là câu chuyện trong Fate/strange Fake, nơi mà mọi thứ đều không như những gì người ta mong đợi.