Trong bối cảnh Chiến tranh thế giới thứ hai đang diễn ra, cậu thiếu niên Mahito phải đối mặt với nỗi đau mất mẹ trong một hoàn anime cảnh bi thảm. Để tìm kiếm sự bình yên, cậu được đưa từ Tokyo về sống tại ngôi nhà nông thôn thanh bình của người mẹ kế Tsuko. Tsuko, một người phụ nữ có nhiều nét giống mẹ của Mahito, đã cố gắng tạo ra một không gian ấm áp cho cậu.
Dù vậy, Mahito vẫn cảm thấy khó khăn trong việc thích nghi với cuộc sống mới. Mọi thứ xung quanh đều xa lạ và đầy bất ngờ. Thế giới nông thôn không giống như những gì cậu tưởng tượng. Một điều kỳ lạ xảy ra khi một con diệc xám xuất hiện, thường xuyên xuất hiện trước cửa nhà cậu. Con diệc này không chỉ gây bối rối cho Mahito mà còn khiến cậu cảm thấy bị cuốn hút một cách lạ lùng.
Con diệc xám dường như có mối liên hệ đặc biệt với Mahito, khi nó gọi cậu là “kẻ được chờ đợi từ lâu”. Cảm giác này khiến cậu không thể không suy nghĩ về ý nghĩa của sự xuất hiện của nó. Liệu đây có phải là một dấu hiệu từ mẹ cậu hay chỉ đơn thuần là sự tình cờ? Những câu hỏi này luôn xoay quanh tâm trí Mahito khi cậu cố gắng tìm ra vị trí của mình trong một thế giới đầy biến động.
Các Cậu Sống Thế Nào? không chỉ đơn thuần là câu chuyện về một cậu bé đang học cách sống trong một hoàn cảnh khó khăn, mà còn là hành trình khám phá bản thân và tìm kiếm sự kết nối với quá khứ. Với sự hiện diện bí ẩn của con diệc xám, Mahito bắt đầu hành trình tìm kiếm ý nghĩa và mục đích sống, đồng thời đối diện với những nỗi đau trong lòng mình.